Inferencia Filogenética Molecular en ambiente de alto Procesamiento Computacional.

Abstract

En los últimos años las Tecnologías de la Información y las Comunicaciones (TICs) han sido las principales protagonistas de los grandes avances científicos ocurridos en las Ciencias Biológicas, lo que ha propiciado el surgimiento de la Bioinformática como nueva disciplina científica. La Inferencia Filogenética Molecular es una de las líneas de investigación que emplea la reciente disciplina para el estudio de las diferentes relaciones evolutivas de los organismos. Para muchos centros de investigación de nuestro país realizar estimaciones filogenéticas constituye un desafío, debido al restringido acceso a los servidores internacionales que poseen y a la baja calidad de los recursos computacionales con la que disponen, teniendo en cuenta además el alto potencial de cómputo que requiere el empleo de dichos métodos para realizar análisis filogénicos. Por esta razón la presente investigación está enmarcada en proveer a la comunidad científica de un módulo de Análisis Filogenético, el cual aprovechará el clúster de computadoras Átropos del departamento de Bioinformática de la Universidad de las Ciencias Informáticas (UCI), para disminuir el tiempo de respuesta de los análisis filogenéticos, contribuyendo de este modo al desarrollo de la Bioinformática en Cuba. La confección de este módulo estuvo guiada por la metodología de desarrollo OpenUp, el lenguaje de programación Java y Eclipse como entorno de desarrollo.