Sistema de recopilacion de datos para el analisis de las interacciones proteina - ligando

Abstract

Desarrollo de un sistema para extraer datos provenientes del Protein Data Bank (PDB)que realice las transformaciones para almacenarlos en una base de datos para ser consultada posteriormente. Los datos a recopilar de la fuente Protein Data Bank seran los contenidos en el formato de archivo PDB, se transformaran a traves del algoritmo implementado por los investigadores del CIM y posteriormente seran cargados en la base de datos para ser consultados. Se determino utilizar el mecanismo de funcionamiento de los procesos ETL en el desarrollo del sistema. La visualizacion de las estructuras moleculares se hara con JmolApplet. Se establecio la metodologia OpenUp, UML como lenguaje de modelado y Visual Paradigm como herramienta para el modelado.